چکیده
هدف : هموفیلوس آنفولانزا یکی از باکتری های کوکوبالیس گرم منفی ویژه ی انسانی است که مسئول تعداد محسولی از عفونت های دستگاه تنفسی و مشکلات شدید تهاجمی مانند مننژیت و عفونت میباشد. هدف این مطالعه توصیف کردن مکانیزم های مقاومت بتا لاکتین در میان نمونه های این باکتری در لهستان و ارزیابی روش های شناسایی مقاومت مورد استفاده میباشد.
روش ها : این مطالعه بر روی 117 نمونه ی تفکیک شده از این باکتری در لهستان انجام شد که در سال 2012 جمع آوری شده بود. کمترین غلظت های بازدارندگی نیز از طریق ریز رقیق سازی بررسی شده بود. تمام این نمونه های رنگ آمیزی شده با استفاده از روش نشر دیسکی ارزیابی شده بودند و الگوریتم پیشنهاد داده شده توسط کمیته ی شمالی در مورد تست های احتمال ضد میکروبی (NordicAST) استفاده شده است. برای شناسایی تغییرات در پروتئین های اتصالی به پنیسیلین 3 (PBP3)، پویش های PCR نیز اجرا شده و بعد از آن توالی سنجی های ژنی ftsl اجرا شده است.
نتایج : نه تولید لاکتان های بتا و نه تغییرات PBP3 در 76 مورد از نمونه های تفکیک شده مشاهده نشد ( 65.0%). حساسیت به آمپیسیلین، آموکسی سیلین/ کلاونیک اسید، سفروکسیم ( درون وریدی) و سفریاکسون در 70.9 % ، 78.6% ، 98.3% ، 82.9% و 100% از نمونه ها به ترتیب، مشاهده شد. تولید لاکتان های بتا در 21 مورد از این تفکیک های نمونه ها مشاهده شد ( 17.9%). پویش PCR 20 نمونه ( 17.1%) با تغییرات PBP3 را نشان داد و بر اساس توانلی سنجی های بعدی ftsl تمام این نمونه ها در نهایت به عنوان gBLNAR ( منفی از نظر لاکتان های بتا به صورت ژنتیکی و مقاوم نسبت به آمپیسیلین)، که در میان این موارد 65.0% مقاوم نسبت به آمپیسیلین بودند. بر اساس طبقه بندی های مولکولی در مورد تغییرات PBP3 ، 95.0 %از gBLNAR ها متعلق به گروه دو بودند که نشان دهنده ی چهار زیر مجموعه به صورت IIa-IId بودند.
جمع بندی : باکتری های هموفیلوس انفلونزا مقاوم نسبت به آنتی بیوتیک ها نیازمند توجه پیوسته ، روش های شناسایی موثر و سیاست های منطقی در مورد استفاده از آنتی بیوتیک ها هستند. الگوریتم پیشنهاد شده توسط NordicAST را میتوان در کار های آزمایشگاهی روتین مورد استفاده قرار داد در حالی که توالی سنجی های ژن های ftsl میتواند در مطالعه های همه گیر شناسی مولکولی مورد استفاده قرار گیرد.
مقدمه
هموفیلوس انفولانزا یکی از باکتری های خاص انسان با گرم منفی میباشد که در قسمت بالایی دستگاه تنفسی انسان به عنوان بخشی از جمعیت های میکروبی به صورت رایج دیده میشود. این باکتری همچنین میتواند مسئول تعداد محسوسی از عفونت های دستگاه تنفسی و همچنین عفونت های تهاجمی شدید مانند مننژیت و عفونت های دیگر باشد که در افراد بالغ و کودکان دیده میشود.
Abstract
Objectives Haemophilus influenzae is a human-specific Gram-negative coccobacillus responsible for a significant number of respiratory tract infections and severe invasive infections such as meningitis and sepsis. The purpose of this study was to characterise the mechanisms of β-lactam resistance among Polish H. influenzae isolates and to evaluate the resistance detection methods applied.
Methods This study was conducted on 117 Polish H. influenzae isolates collected in 2012. Minimum inhibitory concentrations were assessed by broth microdilution. All strains were evaluated using the disk diffusion method and the algorithm proposed by the Nordic Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (NordicAST). To detect changes in penicillin-binding protein 3 (PBP3), PCR screening was performed, followed by ftsI gene sequencing.
Results Neither β-lactamase production nor PBP3 alterations were demonstrated in 76 isolates (65.0%). Susceptibility to ampicillin, amoxicillin, amoxicillin/clavulanic acid, cefuroxime (intravenous) and ceftriaxone was observed in 70.9%, 78.6%, 98.3%, 82.9% and 100% of the isolates, respectively. β-Lactamase production characterised 21 isolates (17.9%). Screening PCR identified 20 isolates (17.1%) with PBP3 alterations, and according to subsequent ftsI sequencing all these strains were finally recognised as gBLNAR (genetically β-lactamase-negative, ampicillin-resistant), among which 65.0% were ampicillin-resistant. According to molecular classification of PBP3 alterations, 95.0% of gBLNAR belonged to group II, representing four subgroups IIa–IId.
Conclusions Haemophilus influenzae resistance to antibiotics requires continuous attention, effective detection methods and a rational policy of antibiotic usage. The algorithm proposed by NordicAST can be applied in routine laboratory work, whereas sequencing of the ftsI gene may be useful in molecular epidemiology studies.
1. Introduction
Haemophilus influenzae is a human-specific Gram-negative coccobacillus commonly found in the upper respiratory tract as part of the physiological bacterial flora. It may also be responsible for a significant number of respiratory tract infections as well as severe invasive infections such as meningitis and sepsis, both in children and in adults.
چکیده
مقدمه
مواد و روش ها
نمونه های تفکیک شده ی مطالعه
شناسایی نمونه ها بر اساس پویش PCR و تولید لاکتاماز بتا
تست های حساسیت نسبت به ضد میکروب ها
توالی سنجی DNA
نتایج
نتایج توالی سازی های ftsl
مباحث
Abstract
1. Introduction
2. Materials and methods
2.1. Study isolates
2.2. Strain denomination according to screening PCR and b-lactamase production
2.3. Antimicrobial susceptibility testing
2.4. DNA sequencing
3. Results
3.1. Evaluation of NordicAST algorithm and EUCAST screening disk test
3.2. Results of ftsI sequencing
3.3. Associations between PBP3 alterations and antimicrobial susceptibility
4. Discussion