توقف مسیر اتصال پایانی غیر همولوگی (NHEJ)، توسط مهارکننده زیرواحد کاتالیزوری کیناز پروتئین وابسته به DNA (DNA-PKcs)
ترجمه شده

توقف مسیر اتصال پایانی غیر همولوگی (NHEJ)، توسط مهارکننده زیرواحد کاتالیزوری کیناز پروتئین وابسته به DNA (DNA-PKcs)

عنوان فارسی مقاله: توقف مسیر اتصال پایانی غیر همولوگی (NHEJ)، توسط مهارکننده زیرواحد کاتالیزوری کیناز پروتئین وابسته به DNA (DNA-PKcs)، با نام NU7026 مانع از تخریب HBV cccDNA توسط کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9) می شود
عنوان انگلیسی مقاله: Suppressing the NHEJ pathway by DNA-PKcs inhibitor NU7026 prevents degradation of HBV cccDNA cleaved by CRISPR/Cas9
مجله/کنفرانس: گزارش های علمی - Scientific Reports
رشته های تحصیلی مرتبط: پزشکی
گرایش های تحصیلی مرتبط: غدد و متابولیسم، ویروس شناسی پزشکی
نمایه: scopus - master journals List - JCR - MedLine - DOAJ - PubMed Central - Master ISC
شناسه دیجیتال (DOI): https://doi.org/10.1038/s41598-019-38526-6
دانشگاه: موسسه تحقیقات مرکزی اپیدمیولوژی، هپاتیت ویروسی، فدراسیون روسیه
صفحات مقاله انگلیسی: 11
صفحات مقاله فارسی: 26
ناشر: Nature
نوع ارائه مقاله: ژورنال
نوع مقاله: ISI
سال انتشار مقاله: 2019
ایمپکت فاکتور: 4.130 در سال 2020
شاخص H_index: 213 در سال 2021
شاخص SJR: 1.240 در سال 2020
ترجمه شده از: انگلیسی به فارسی
شناسه ISSN: 2045-2322
شاخص Quartile (چارک): Q1 در سال 2020
فرمت مقاله انگلیسی: pdf و ورد تایپ شده با قابلیت ویرایش
وضعیت ترجمه: ترجمه شده و آماده دانلود
فرمت ترجمه فارسی: pdf و ورد تایپ شده با قابلیت ویرایش
مشخصات ترجمه: تایپ شده با فونت B Nazanin 14
مقاله بیس: خیر
مدل مفهومی: ندارد
کد محصول: 11769
رفرنس: دارای رفرنس در داخل متن و انتهای مقاله
پرسشنامه: ندارد
متغیر: ندارد
درج شدن منابع داخل متن در ترجمه: بله
ترجمه شدن توضیحات زیر تصاویر و جداول: بله
ترجمه شدن متون داخل تصاویر و جداول: بله
رفرنس در ترجمه: در داخل متن و انتهای مقاله درج شده است
نمونه ترجمه فارسی مقاله

هپاتیت مزمن B، یک بیماری شدید کبدی است که توسط انتقال ویروس هپاتیت B (HBV) ایجاد می شود. DNA حلقوی بسته کووالانسی (cccDNA)، یک شکل استاندارد دوگانه فوق مارپیچ از ژنوم HBV، تعیین کننده اصلی پایداری ویروسی است. در حال حاضر، نوکلئاز های کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9) نشان داده شده اند تا DNA دو رشته ای را معرفی کنند که به HBV cccDNA شکسته می شود. آسیب تحمیلی، عمدتا در ترمیم نادرست cccDNA ، از  اتصال پایانی غیرهمولوگی (NHEJ)  ناشی می شود. NHEJ (اتصال پایانی غیرهمولوگی) پیشنهاد می شود تا فعالیت ضد HBV از کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9)را بهبود دهد و جهش cccDNA را افزایش دهد. در این تحقیق، ما فعالیت ضد HBV از کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9)و نتایج ترمیم cccDNA را در یک محیط NHEJ/HR اصلاح یافته، مورد ارزیابی قرار دادیم. NU7026، یک مهارکننده قوی NHEJ است که مانع از تخریب میانی کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9)از cccDNA شده است و منجر به حذف های تکرار شونده هدفمند شده است. ما نتیجه می گیریم که کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9)یک ابزار بسیار موثر برای تخریب cccDNA است و ابتدا نشان می دهد که مهار NHEJ باعث کاهش تخریب cccDNA می شود. 

ویروس هپاتیت B (HBV)، به طور مداوم، 250 میلیون نفر را در سراسر جهان آلوده می کند، و بیش از یک میلیون نفر از عواقب هپاتیت مزمن B (CHB) می میرند، که عمدتا سیروز و کارسینوم هپاتوسلولار (HCC) است (3-1) . HBV متعلق به خانواده هپادناویریده  است. ژنوم ویروسی ذره پوششی HBV شامل یک DNA دوگانه استاندارد جزئی سلولی است که از یک میانه RNA با استفاده از یک ترانس کریپتاز معکوس ، ترکیب می شود. پس از ورود، ویروس های HBV بدون پوشش هستند، و DNA حلقوی ساکن به نوکلئازی منتقل می شود که ان نوکلئاز از DNA حلقوی بسته کووالانسی (cccDNA) ترمیم می شود. cccDNA، مولفه کلیدی از چرخه عمر HBV است که بعنوان یک الگو برای رونویسی تمام RNAهای پیام رسان (mRNA) ویروسی شامل RNA پیش-ژنومی (pgRNA) بکار گرفته می شود (6-4).

توالی نسل-بعدی. نواحی هدف دار توسط کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9)و نواحی بدون هدف پتانسیل با استفاده از جفت پرایمرهای خاص و پلی مراز Q5 تقویت می شوند. امپلیکون ها با ژل تخلیص می شوند و با استفاده از کیت استخراج ژل کیاژن، استخراج می شوند، با یک فلورومتر کوبیت 2.0 (فناوری های عمر) اندازه گیری می شوند، و در نسبت های اکیومولار   یکی می شوند. سپس، آداپتورها برای توالی ایلومینا  پیوست می شوند. مجموعه اطلاعات (library) با 250 جفت بازخوانی نهایی با استفاده از ابزار MiSeq (ایلومینا) دنبال می شوند. نرم افزار FASTQC و نرم افزار جنیوس (Geneious ) برای ارزیابی کیفیت، همترازی منبع، دور انداختن بازخوانی های کیفیت پایین/ نوکلئوتیدها  ، و محاسبه جایگزین ها و ایندل ها، استفاده می شوند. کیفیت توالی از قبل- باز  و نمره های کیفیت پیش-توالی  در تمام گروه ها بیشتر از 30 بودند. 

نمونه متن انگلیسی مقاله

Chronic hepatitis B is a severe liver disease caused by hepatitis B virus (HBV) infection. Covalently closed circular DNA (cccDNA), a super-spiralized, double-stranded form of the HBV genome, is the major determinant of viral persistence. CRISPR/Cas9 nucleases have been recently shown to introduce doublestranded DNA breaks into HBV cccDNA. The inficted damage results predominantly in erroneous repair of cccDNA by non-homologous end-joining (NHEJ). NHEJ has been suggested to enhance anti-HBV activity of CRISPR/Cas9 and increase cccDNA mutation. In this study, we assessed anti-HBV activity of CRISPR/Cas9 and cccDNA repair outcomes in an altered NHEJ/HR environment. NU7026, a strong inhibitor of NHEJ, prevented CRISPR/Cas9-mediated degradation of cccDNA and resulted in frequent on-target deletions. We conclude that CRISPR/Cas9 is a highly efective tool to degrade cccDNA and frst demonstrate that inhibiting NHEJ impairs cccDNA degradation.

Hepatitis B virus (HBV) chronically infects 250 million people worldwide, and more than a million people die from consequences of chronic hepatitis B (CHB), mainly cirrhosis and hepatocellular carcinoma (HCC)1–3 . HBV belongs to the family Hepadnaviridae. Te viral genome of the enveloped HBV particle comprises a circular, partially double-stranded DNA that is synthesized from an RNA intermediate using a reverse transcriptase. Upon entry, HBV virions are uncoated, and relaxed circular DNA is transported into the nucleus where it is repaired to form covalently closed circular DNA (cccDNA). cccDNA is the key component of that HBV life cycle that serves as a template for transcription of all viral mRNAs including pre-genomic RNA (pgRNA)4–6

Next-generation sequencing. Regions targeted by CRISPR/Cas9 and potential off- arget regions were amplifi d using pairs of specific primers and Q5 polymerase. Amplicons were gel-purifi d and extracted using Qiagen gel extraction kit, quantifi d with a Qubit 2.0 Fluorometer (Life Technologies), and pooled in equimolar ratios. Adapters for Illumina sequencing were then attached. Libraries were sequenced with 250 paired-end reads using the MiSeq instrument (Illumina). FASTQC sofware and Geneious sofware were used for quality assessment, reference alignment, discarding low-quality reads/nucleotides, and calculating substitutions and indels. Per-base sequence quality and per-sequence quality scores in all groups were >30.

تصویری از فایل ترجمه

          

(جهت بزرگ نمایی روی عکس کلیک نمایید)

ترجمه فارسی فهرست مطالب

نتایج

سمی بودن مولکول های کوچک و تاثیرات بر پایداری و چرخه سلولی

طراحی کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9).

فعالیت ضد HBV، کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9) در یک محیط NHEJ/HR.

مهار NHEJ توسط NU7026 منجر به ویرایش بیش از حد میانی-کریسپر/کَس 9 (CRISPR/Cas9) از HBV ccDNA می شود.

بحث 

مواد و روش ها

کشت سلولی و ترانسفکشن

مولکول های کوچک

تحلیل قابلیت زیستی سلول

ساختارهای CRISPR/Cas9.

جداسازی اسیدهای نوکلئیک

تحلیل PCR.

ایمونوفلورسانس (پرتوافشانی ایمن).

تشخیص آپوپتوسیس

توالی نسل-بعدی

تحلیل آماری

منابع

فهرست انگلیسی مطالب

Results 

Toxicity of small molecules and efects on viability and cell cycle

Design of CRISPR/Cas9

Anti-HBV activity of CRISPR/Cas9 in an altered NHEJ/HR environment

Inhibition of NHEJ by NU7026 results in CRISPR/Cas9-mediated hyper-editing of HBV cccDNA

Discussion

Materials and Methods

Cell culture and transfection.

Small molecules

Cell viability analysis.

CRISPR/Cas9 constructs.

Isolation of nucleic acids

PCR analysis

Immunofuorescence

Apoptosis detection

Next-generation sequencing

Statistical analysis

References

محتوای این محصول:
- اصل مقاله انگلیسی با فرمت pdf
- اصل مقاله انگلیسی با فرمت ورد (word) با قابلیت ویرایش
- ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد (word) با قابلیت ویرایش، بدون آرم سایت ای ترجمه
- ترجمه فارسی مقاله با فرمت pdf، بدون آرم سایت ای ترجمه
قیمت محصول: ۴۰,۸۰۰ تومان
خرید محصول
توقف مسیر اتصال پایانی غیر همولوگی (NHEJ)، توسط مهارکننده زیرواحد کاتالیزوری کیناز پروتئین وابسته به DNA (DNA-PKcs)
مشاهده خریدهای قبلی
مقالات مشابه
نماد اعتماد الکترونیکی
پیوندها