تحلیل ژنتیکی تنوع ماده اصلی وراثت نیشکر محلی چینی مبتنی بر چند ریختی آماج استارت کدون
اطلاعات عمیق و کامل ماده اصلی وراثت نیشکر اساس و پایه حفظ ، بقا و کاربرد آن را تشکیل می دهد. داده های نشانه های مولکولی نیشکر در مجموعه ماده اصلی وراثت نیشکر چینی محدود می شود. 20 آغازگر تشانه گر آماج رمز آغازگر ( SCoT) جهت بررسی و ارزیابی تنوع ژنتیکی بین 107 الحاق و ضمیمه نیشکر در مجموعه ماده اصلی وراثت نیشکر محلی پرورش داده شدند. این آغازگر ها 176 قطعه دی ان آ را افزایش و تقویت کردند ، که 163 قطعه از بین 176 قطعه چند ریختی بودند ( 82.85%). مقددار ظرفیت و محتویات اطلاعات چند ریختی ( PIC) با میانگین 0.861 بین 0.783 تا 0.907 است. روش تحلیل خوشه ای میانگین های جبری گروه جفت شده ناموزون ( UPGMA) داده های نشانه گر SCoT الحاق و دخول 107 نیشکر را به شش خوشه با ضریب تشابه ژنتیکی 0.674 تقسیم کرد. تنوع نسبتاٌ فراوان ژنتیکی بین ROC22 ، ROC16 و ROC10 مشاهده شد که تقریباٌ 50% از کل زمین ها ی نیشکر چین را اشغال میکردند ، و این ارزش کشت و پرورش بالقوه این محصول را در Mainland چین نشان می دهد . تحلیل مولفه اصلی ( PCA) 107 الحاق نیشکر را به دو گروه اصلی یعنی گروه خانگی و داخلی و گروه ورود خارجی تقسیم میکند. هر یک از گروه ها براساس موسساتی که الحاق نیشکر اصولاٌ توسعه داده شده بود ، تقسیم شدند . دانش تنوع ژنتیکی بین کل ماده اصلی وراثت نیشکر داده های اصلی مدیریت ماده اصلی وراثت نیشکر را مثل ساخت مجموعه اصلی و توزیع تنوع منطقه ای و زیر گونه ای فراهم ساخت و ارایه داد.
1-مقدمه
نیبشکر (Saccharum spp) بعلت تولید بیش از نود درصد از کل قند مصرفی کشور مهمترین محصول قندی است . نیشکر نیز به عنوان یک گیاه علقی مهمترین منبع انرژی است . طبق گزارشات ارایه شده اصلاح ژنتیکی نیشکر منجر به 75درصد افزایش عملکرد صنعت نیشکرهاوایی در دهه 1950 و >60% افزایش عملکرد این محصول در Mainland چین در دهه ها ی اخیر شده است .. خطوط والدین یا پدر و مادری دارای فاصله بیشتر ژنتیکی طبق نظریه هتروزیس باید برای عملیات پیوند دو رگه گیری در زمان رشد کشت واره روی آغاز گری انتخاب شود که صفات اصلی خطوط ووالدین کامل و تکمیلی هستند.
In-depth information on sugarcane germplasm is the basis for its conservation and utilization. Data on sugarcane molecular markers are limited for the Chinese sugarcane germplasm collections. In the present study, 20 start codon targeted (SCoT) marker primers were designed to assess the genetic diversity among 107 sugarcane accessions within a local sugarcane germplasm collection. These primers amplified 176 DNA fragments, of which 163 were polymorphic (92.85%). Polymorphic information content (PIC) values ranged from 0.783 to 0.907 with a mean of 0.861. Unweighted pair group method of arithmetic averages (UPGMA) cluster analysis of the SCoT marker data divided the 107 sugarcane accessions into six clusters at 0.674 genetic similarity coefficient level. Relatively abundant genetic diversity was observed among ROC22, ROC16, and ROC10, which occupied about 80% of the total sugarcane acreage in China, indicating their potential breeding value on Mainland China. Principal component analysis (PCA) partitioned the 107 sugarcane accessions into two major groups, the Domestic Group and the Foreign Introduction Group. Each group was further divided based on institutions, where the sugarcane accessions were originally developed. The knowledge of genetic diversity among the local sugarcane germplasm provided foundation data for managing sugarcane germplasm, including construction of a core collection and regional variety distribution and subrogation.
1. Introduction
Sugarcane (Saccharum spp.) is the most important sugar crop in China by producing more than 90% of the total consumable sugar [1, 2]. Sugarcane is also an important energy source as an herbaceous plant. It was reported that genetic improvement of sugarcane accounted for 75% of the yield increase in Hawaiian sugar industry in the 1950s and >60% yield increase on Mainland China in recent decades [1, 3]. According to the heterosis theory, parental lines with larger genetic distance values must be selected for crossing during cultivar development on the premise that the main attributes of the parental lines are complementary [4–6].
1-مقدمه
2- مواد و روشهای تحقیق
3- نتایج
2-3 شباهت ژنتیکی
3-3 تحلیل خوشه ای
4-3 تحلیل مولفه اصلی
5-3: تنوع ژنتیکی در مجموع ماده اصلی وراثت نیشکر محلی
4- استدلال و نتیجه گیری
1. Introduction
2. Materials and Methods
2.1. Sugarcane Accessions within a Local Sugarcane Germplasm Collection
2.2. SCoT Primers
2.3. Extraction of Sugarcane Genomic DNA
2.4. SCoT-PCR Amplification and Detection
2.5. Statistical Analysis
3. Results
3.1. SCoT Polymorphism in Sugarcane
3.3. Cluster Analysis
3.4. Principal Component Analysis
3.5. Genetic Diversity within the Local Sugarcane Germplasm Collection
4. Discussion and Conclusions
- ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد (word) با قابلیت ویرایش، بدون آرم سایت ای ترجمه
- ترجمه فارسی مقاله با فرمت pdf، بدون آرم سایت ای ترجمه