چکیده
باسیلوس مگاتریوم به عنوان مواد تلقیحی زیستی موثر و اقتصادی، برای استفاده در سیستم های تلفیقی غذایی و کنترل آفات مورد حمایت واقع شده است. باسیلوس مگاتریوم از خاک مناطق مختلف اقلیمی کشاورزی کارناتاکا جدا و شناسایی شدند. بررسی مولکولی ایزوله های باسیلوس مگاتریوم با استفاده از روش RAPD انجام شد. بررسی اثر باکتری باسیلوس مگاتریوم بر جوانه زنی بذر سساموم ایندیکوم و رشد گیاه سساموم ایندیکوم انجام شد. برآورد میزان فسفات موجود در ریشه و اندام هوایی گیاهان نیز صورت گرفت.
مقدمه
خاک به عنوان یک مخزن برای میلیون ها میکروارگانیسم ها عمل می کند که حدود بیش از 85٪ از آن ها برای زندگی گیاه مفید هستند. بنابراین، خاک یک سیستم محیطی عکس العملی بوده و میکروارگانیسم های زنده خاک زندگی فوق العاده ای را برای سیستم های خاک برای فراهم کردن غذا برای رشد گیاه تامین می کنند. میکروارگانیسم های خاک نقش حیاتی را در شرایط کامل خاک های مورد استفاده کشاورزی و در تحریک رشد گیاه ایفا می کنند.
میکروارگانیسم های مفید ریزوسفر که در ارتباط نزدیک با ریشه ها هستند، ریزوباکترهای محرک رشد گیاه (PGPR ) نامیده شده (1) و ترکیب عالی از صفات مفید برای کنترل بیماری ها و افزایش در دسترس بودن مواد غذایی را ارائه می دهد، که منجر به تغییرات مطلوب قابل قبول در رشد گیاه، جوانه زنی و فعالیت های متابولیک می شود. در میان PGPR، باسیلوس مگاتریوم به عنوان مواد تلقیحی زیستی موثر و اقتصادی، برای استفاده در سیستم های تلفیقی غذایی و کنترل آفات مورد حمایت واقع شده است. باسیلوس مگاتریوم یک باکتری گرم مثبت و میله ای شکل بوده که تولید اندوسپور می کند. این باکتری هوازی بوده اما همچنین در صورت لزوم، قادر به رشد در شرایط بی هوازی است (2 و 3).
ABSTRACT
Bacillus megaterium have been advocated as effective and economical bio inoculant to use in the integrated nutrient and pest control system. Bacillus megaterium from soil of different Agro climatic zones of Karnataka were isolated and identified. Molecular characterization of the Bacillus megaterium isolates was done using RAPD technique. The study of effect of Bacillus megaterium on seed germination of Sesamum indicum and on plant growth of Sesamum indicum was carried out. Estimation of amount of phosphate present in plants both roots and shoots was also carried out.
INTRODUCTION
The soil acts as a reservoir for millions of microorganisms, of which approximately more than 85% are beneficial for plant life. Thus, the soil is a resilient eco system and soil microorganisms provide precious life to soil systems catering to plant growth. Soil microorganisms play a vital role in the evolution of agriculturally use full soil conditions and in stimulating plant growth. Beneficial rhizosphere microorganisms that are closely associated with roots have been termed Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR) [1], offer an excellent combination of traits useful for both disease control and increased nutrient availability which leads to the identifiable desirable changes in plant growth, seed germination and metabolic activities. Amongst the PGPR, Bacillus megaterium have been advocated as effective and economical bio inoculant to use in the integrated nutrient and pest control system. Bacillus megaterium is a gram positive, rod shaped endospore-forming bacteria. It is considered aerobic, but, it is also capable of growing under anaerobic conditions when necessary [2,3].
چکیده
مقدمه
مواد و روش ها
جداسازی باسیلوس مگاتریوم
شناسایی جدایه ها
پروتکل استخراج DNA
شرایط تکثیر PCR
واکنش گرهای مورد استفاده در PCR
انتخاب پرایمرها
الکتروفورز ژل آگارز
تجزیه و تحلیل داده های RAPD
تجزیه و تحلیل مولفه اصلی ( PCA)
بررسی رشد گیاه
مشاهده رشد گیاه
بررسی جوانه زنی بذر
قرار دادن بذر تحت تاثیر باکتری
جداسازی و شناسایی
جداسازی
شناسایی
شرایط تکثیر
پارامترهای واکنش
خصوصیات RAPD
تجزیه و تحلیل خوشه ای و ماتریس عدم تشابه ژنتیکی ده ایزوله از Bm
تجزیه و تحلیل PCA
نتایج جوانه زنی بذر سساموم ایندیکوم
نتیجه گیری
ABSTRACT
INTRODUCTION
MATERIALS AND METHODS
Isolation of Bacillus megaterium
Identification of the isolates
DNA extraction protocol
PCR amplification conditions
Reagents used in the PCR
Selection of primers
Agarose gel electrophoresis
Analysis of RAPD data
Principal component analysis (PCA)
Plant growth studies
Observation for Plant growth
Seed germination studies
Seed bacterization
RESULTS
Isolation and Identification
Isolation
Identification
Amplification conditions
Reaction parameters
RAPD characterization
Cluster analysis and genetic dissimilarity matrix of 10 Bm isolates
PCA Analysis
CONCLUSION