یک مجموعه پرایمر جدید در یک ژن SRY برای تعیین جنسیت
چکیده
تعیین جنسیت با استفاده از تست جنسیت آمیلوژنین به صورت روتین در پرونده های قضایی، تشخیص پیش از تولد، و داده پایگاه DNA اجرا می شود. به هرحال، به نظر نمی رسد که این تست کاملا موثق باشد. ما یک جفت جدید از پرایمرها را طراحی کردیم که یک بخشی از ژن SRY را هدف می گیرند که منجر به ایجاد یک قطعه ی PCR اختصاصی جنس مذکر 96 جفت بازی می شود که می تواند با کیت های STR مرکب هم تکثیر شود که شناسایی سریع و غیرمبهم جنس را تضمین می کند. قابلیت کاربرد و اختصاصیت پرایمرها با DNA گرفته شده از نمونه ی DAM تایید شد.
1. مقدمه
تعیین جنسیت نه تنها می تواند یک بخش مهمی از اطلاعات در بررسی های قانونی مختلف باشد به ویژه در موارد تجاوز جنسی، بلکه همچنین می تواند در تشخیص پیش از تولد رویان، با یک سابقه ی خانوادگی مشخص از بیماری های ژنتیکی که فقط کودکان پسر را تحت تاثیر قرار می دهند سودمند باشد. اگرچه مشخص شده است که روش های مبتنی بر PCR مختلف، یک نمونه ای که از یک زن یا مرد گرفته شده اند را شناسایی می-کنند، اما تنها تست جنسیت که در کیت های PCR شناسایی انسانی به صورت تجاری برای تعیین جنسیت، در دسترس است، بر اساس تست جنسیت آمیلوژنین می باشد که توسط سولیوان و همکارانش توصیف شده بود (1). این تست سریع و موثر می باشد، با این حال، مطالعات جدید نشان داده اند که آن همیشه معتبر نیست. گزارش شده است که فراوانی حذف کپی Y از ژن آمیلوژنین بین 8% و 0.018% رخ می دهد که بستگی به جمعیت دارد (7-2) و مردهای دارای حذف آمیلوژنین (که تحت عنوان DAMsها شناسایی می-شوند) به عنوان زن شناسایی می شوند. با در نظر گرفتن پیامدهای نتایج به دست آمده با استفاده از یک مارکر آمیلوژنین، برخی محققین، استفاده از مارکرهای ژنتیکی جدید که روی منطقه Y (SRY) تعیین جنسیت روی کروموزوم Y تکیه داشتند را گزارش کرده بودند (2،4،5،7-9). در همه ی موارد، دقت تعیین جنسیت با استفاده از یک واکنش PCR دیگر با استفاده از پرایمرهایی برای SRY به تنهایی یا ترکیبی از پرایمرها برای SRY و آمیلوژنین تست شده بود. اما این رویکرد، سخت و زمان بر می باشد. برای غلبه بر این اشکال، ما احتمالات طراحی یک جفت جدید از پرایمرها را بررسی کردیم به طوری که اندازه ی محصول تکثیر SRY و همچنین شرایط PCR مناسب واکنش های تکثیر کیت های STR مرکب تجاری باشد. ما یک مجموعه پرایمر جدید را طراحی کردیم که بعداز تکثیر، یک محصول 96 جفت بازی ارائه می کند. در این مطالعه، یک مارکر SRY که به تازگی طراحی شده بود برای تعیین جنسیت، به عنوان یک بخشی از کیت های STR مرکب، از نظر حساسیت و اختصاصیت خودش توسط تست با مقادیر پایین DNA مرد و مقادیر بالای DNA زن آنالیز شد. در مرحله ی آخر، قابلیت کاربرد مارکر SRY با DNA گرفته شده از مرد دارای حذف آمیلوژنینی تست شد.
Abstract
Determination of sex using the amelogenin sex test has been routinely performed in forensic casework, prenatal diagnosis and DNA data basing. However, the test does not appear to be entirely reliable. We designed a new pair of primers that target a section of the SRY gene resulting in 96-bp male-specific PCR fragment that can be coamplified with multiplex STR kits which assures unambiguous and quick gender identification. The applicability and specificity of the primers were confirmed with DNA from DAM sample.
1. Introduction
Sex determination not only can be an important piece of information in various forensic investigations, especially in sexual assault cases, but can also be useful in prenatal diagnosis of foetus with a known family history of genetic disorder affecting only male children. Although different PCR-based methods are known to identify a sample as originating from a male or a female, the only sex test included in commercially available human identification PCR kits for gender determination is based on the amelogenin sex test described by Sullivan et al. [1]. The test is quick and effective, however, new studies showed that it is not always reliable. The frequency of the deletion of Y copy of the amelogenin gene has been reported that occurs between 8% and 0.018% depending on the population [2–7] and bdeleted-amelogenin malesQ (designed as DAMs) would have been identified as women. Considering the consequences of the result obtained using only an amelogenin marker, some authors have already reported the use of new genetic markers lying on the sex-determination region Y (SRY) on the Y chromosome [2,4,5,7–9]. In all cases, the accuracy of sex determination has been tested by an additional PCR reaction using only the primers for SRY or the combination of primers for SRY and amelogenin. But this procedure is labourious and time consuming. To overcome the drawback, we investigated possibilities to design a new pair of primers so that the size of the SRY amplification product as well as PCR conditions would suit the amplification reactions of commercially multiplex STR kits. We designed a new primers set which after amplification yielded a 96-bp product. In this study, a newly designed SRY marker was analysed for determination of sex as a part of multiplex STR kits regarding its sensitivity and specificity by testing with low amount of male DNA and with high amount of female DNA, respectively. In the last stage, the applicability of SRY marker was tested with DNA from deleted-amelogenin male.
چکیده
1. مقدمه
2. مواد و روش ها
3. نتایج و بحث
Abstract
1. Introduction
2. Materials and methods
3. Results and discussion
- ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد (word) با قابلیت ویرایش، بدون آرم سایت ای ترجمه
- ترجمه فارسی مقاله با فرمت pdf، بدون آرم سایت ای ترجمه