مقایسه متدهای استخراج مستقیم دی ان ای میکروبی از خاک های شالیزار
ترجمه شده

مقایسه متدهای استخراج مستقیم دی ان ای میکروبی از خاک های شالیزار

عنوان فارسی مقاله: مقایسه روش های استخراج مستقیم DNA میکروبی از خاک های مختلف شالیزار
عنوان انگلیسی مقاله: Comparisons of direct extraction methods of microbial DNA from different paddy soils
مجله/کنفرانس: مجله علوم زیستی عربستان سعودی - Saudi Journal of Biological Sciences
رشته های تحصیلی مرتبط: کشاورزی
گرایش های تحصیلی مرتبط: بیولوژی و بیوتکنولوژی خاک، شیمی خاک و علوم خاک
کلمات کلیدی فارسی: روش استخراج، DNA میکروبی، پاکسازی، خاک پودری
کلمات کلیدی انگلیسی: Extraction method, Microbial DNA, Purification, Paddy soil
نوع نگارش مقاله: مقاله پژوهشی (Research Article)
نمایه: scopus - master journals - JCR - MedLine - DOAJ - PubMed Central - Master ISC
شناسه دیجیتال (DOI): https://doi.org/10.1016/j.sjbs.2012.04.001
دانشگاه: گروه شیمی کشاورزی، دانشگاه ملی چانگبوک، جمهوری کره
ناشر: الزویر - Elsevier
نوع ارائه مقاله: ژورنال
نوع مقاله: ISI
سال انتشار مقاله: 2012
ایمپکت فاکتور: 3.138 در سال 2017
شاخص H_index: 27 در سال 2019
شاخص SJR: 0.758 در سال 2019
شناسه ISSN: 1319-562X
شاخص Quartile (چارک): Q1
صفحات مقاله انگلیسی: 6
صفحات ترجمه فارسی: 13
فرمت مقاله انگلیسی: pdf
فرمت ترجمه فارسی: ورد و pdf
مشخصات ترجمه: تایپ شده با فونت B Nazanin 14
ترجمه شده از: انگلیسی به فارسی
مقاله بیس: بله
درج شدن منابع داخل متن در ترجمه: بله
ترجمه شدن توضیحات زیر تصاویر و جداول: بله
ترجمه شدن متون داخل تصاویر و جداول: بله
کد محصول: 9315
ترجمه فارسی فهرست مطالب

چکیده


1- مقدمه


2- مواد و روش ها 


2-1- جمع آوری نمونه


2-2- استخراج DNA  خاک


2-3- ارزیابی کیفیت و کمیت DNA


2-4- خالص سازی DNA 


2-5- تجزیه و تحلیل های آماری


3- نتایج و بحث


4- نتیجه گیری

فهرست انگلیسی مطالب

Abstract


1. Introduction


2. Materials and methods


 2.1. Sample collection


2.2. Extraction of soil DNA


2.3. Evaluation of DNA quality and quantity


2.4. Purification of DNA


2.5. Statistical analyses


3. Results and discussion


4. Conclusion

نمونه ترجمه فارسی مقاله

چکیده


آنالیزهای مولکولی برای مطالعه جمعیت های میکروبی خاک اغلب به استخراج مستقیم DNA از خاک ها بستگی دارد. مطالعه حاضر کارایی سه روش مختلف استخراج DNA میکروبی را از هفت خاک متفاوت شالیزار مقایسه می کند. مقایسه بین روش های مختلف استخراج DNA در مورد نمونه های مختلف خاک شالیزار، در محصول DNA اختلاف مشخصی را از 18/3-17/20 نشان داد. مقایسه بین روش های مختلف استخراج DNA در نمونه های مختلف خاک شالیزار نشان دهنده اختلاف قابل ملاحظه ای در محصول DNA از 18/3- 17/20 میکروگرم DNA/ گرم از خاک خشک  است. اگرچه صرف نظر از نمونه های خاک و روش های استخراج، اندازه قطعه DNA بیشتر از 10 kb بود. دز بین روش های ارزیابی شده، روش C (شیمیایی- آنزیمی- مکانیکی) کارایی استخراج سلول و محصول DNA بهتری داشت. پس از خالص سازی DNA خام  توسط کیت خالص سازی، نسبت A260 /A230 و A260/A280 DNA به دست آمده از طریق روش C به ترتیب به 27/2 و 89/1 رسید که کارایی این تکنیک در حذف هیومیک اسید، پروتئین و سایر آلودگی ها را نشان می دهد. نتایج ارزیابی جامع روش های استخراج DNA پیشنهاد کرد که روش C بهتر از دو روش دیگر (شیمیایی- آنزیمی و شیمیایی-مکانیکی) بوده و بهترین انتخاب برای استخراج کل DNA از نمونه های خاک بود. از آنجایی که نوع خاک و خصوصیات جامعه میکروبی روی بازیابی DNA تاثیر می-گذارند، این بررسی راهنمایی را برای انتخاب روش های مناسب استخراج و خالص سازی بر اساس اهداف آزمایشی فراهم کرد. 


1- مقدمه


جمعیت های میکروبی نقش حیاتی را در حفظ حاصلخیزی خاک با تنظیم چرخه، حفظ و رهاسازی مواد غذایی اساسی در خاک ایفا می کنند (Torsvik and Øvrea˚s, 2002; Islam et al., 2011). اما تا کنون تا 99 درصد از میکروب های موجود در خاک، برای پژوهش های پایه ای بیوتکنولوژی نه قابل کشت هستند و نه قابل دسترس (Knietsch et al., 2003; Lakay et al., 2007). روش های مرسومی که در حال حاضر استفاده می شوند ظاهرا دقیق نیستند و نتایج به دست آمده به سختی پروفایل جامعی از تنوع میکروبی in situ خاک را نشان می دهند (Luo et al., 2003). از طرف دیگر، تکنیک های مولکولی مثل تکثیر PCR ژن های 16S rRNA و سایر ژن های مهم اکولوژیکی، نسبت به روش های سنتی تر، اطلاعات نسبتا کم مربوط به جمعیت های میکروبی را افزایش می دهد. بنابراین آنالیزهای مولکولی جمعیت های میکروبی در نمونه های ترکیبی محیطی مثل خاک، روش های کارآمد استخراج DNA را تضمین می کند.

نمونه متن انگلیسی مقاله

Abstract


Molecular analyses for the study of soil microbial communities often depend on the direct extraction of DNA from soils. The present work compares the effectiveness of three different methods of extracting microbial DNA from seven different paddy soils. Comparison among different DNA extraction methods against different paddy soil samples revealed a marked variation in DNA yields from 3.18–20.17 lg DNA/g of dry soil. However, irrespective of the soil samples and extraction methods the DNA fragment size was >10 kb. Among the methods evaluated, method-C (chemical–enzymatic–mechanical) had better cell lysis efficiency and DNA yield. After purification of crude DNA by Purification Kit, A260/A230 and A260/ A280 ratios of the DNA obtained by method-C reached up to 2.27 and 1.89, respectively, sustaining the efficacy of this technique in removing humic acid, protein and other contaminants. Results of the comprehensive evaluation of DNA extraction methods suggest that method-C is superior to other two methods (chemical–enzymatic and chemical– mechanical), and was the best choice for extraction of total DNA from soil samples. Since soil type and microbial community characteristics influence DNA recovery, this study provides guidance for choosing appropriate extraction and purification methods according to experimental goals.


1. Introduction


Microbial communities play a critical role in maintaining soil productivity by regulating the cycling, retention and release of major nutrients in soil (Torsvik and Øvrea˚s, 2002; Islam et al., 2011). But till to date, up to 99% of the microbes present in soil are neither cultivable nor accessible for basic biotechnological research (Knietsch et al., 2003; Lakay et al., 2007). Conventional approaches currently being used appear to be inaccurate, and the results obtained hardly indicate comprehensive profile of soil microbial diversity in situ (Luo et al., 2003). On the other hand, molecular techniques such as PCR amplification of 16S rRNA genes or other genes of ecological significance yield relatively less biased information about microbial communities than traditional culturing approaches. Therefore, molecular analyses of microbial communities in complex environmental samples such as soil warrant efficient unbiased DNA extraction procedures.

محتوای این محصول:
- اصل مقاله انگلیسی با فرمت pdf
- ترجمه فارسی مقاله با فرمت ورد (word) با قابلیت ویرایش، بدون آرم سایت ای ترجمه
- ترجمه فارسی مقاله با فرمت pdf، بدون آرم سایت ای ترجمه
قیمت محصول: ۲۶,۱۰۰ تومان
خرید محصول

دیدگاه خود را بنویسید:

تاکنون دیدگاهی برای این نوشته ارسال نشده است