چکیده
میکرو RNA ها (miRNAs) یک رده از RNA های غیر کدشونده ی کوچک هستند که بیان ژن را با هدف-گیری mRNA ها کنترل کرده و باعث سرکوب ترجمه یا تخریب RNA می شوند. بیان نادرست آن ها ممکن است در بیماری های انسانی، از جمله سرطان دخالت داشته باشد. در واقع، بیان نادرست miRNA قبلا در لوسمی لنفوسیتی مزمن انسان یافت شده است، که در آن امضاهای miRNA با ویژگی های خاص بالینی شناختی مرتبط است. در اینجا ما نشان می دهیم که miRNA ها در سرطان سینه انسان، در مقایسه با بافت طبیعی پستان به صورت نادرست بیان می شوند. بیان کلی miRNA می تواند بافت های عادی و سرطانی را به طور واضح از هم جدا کند، که مهترین miRNA های کاهش یافت، mir-125b, mir-145, mir-21 و mir-155 هستند. نتایج با استفاده از ریزآرایه و آنالیز نورترن بلات تایید شدند. ما می توانیم miRNA هایی که بیان آن با ویژگی های بیولوژیکی خاصی از سرطان پستان مرتبط است را شناسایی کنیم، مانند بیان گیرنده ی استروژن و پروژسترون، مرحله تومور، تهاجم عروقی یا شاخص تکثیر. (Cancer Res 2005؛ 65 (16): 7065-70)
مقدمه
MicroRNAs (miRNAs) نشان دهنده یک رده از مولکول های RNA کوچک غیرکدشونده طبیعی هستند که متمایز از RNA های دخیل بوده ولی با آن ها در ارتباط هستند. miRNA های بالغ، مولکول هایی با طول 19 تا 25 نوکلئوتید هستند که از پیش سازهای پیش mIRNA سرسنجاقی 70 تا 100 نوکلئوتیدی شکسته شده اند (1). پیش ساز توسط RNase III Dicer سیتوپلاسمی به دوپلکس miRNA 22 نوکلئوتیدی تقسیم می شود: یک رشته (miRNA) از دوپلکس با طول عمر کوتاه تخریب می شود، در حالی که رشته های دیگر به عنوان miRNA بالغ باقی می مانند. در حیوانات، miRNA تک رشته ای با همولوژی توالی جزئی به ناحیه غیر ترجمه شده ی 3' (3' UTR) mRNA های هدف متصل شده و باعث بلوکه شدن ترجمه یا، کمتر باعث از بین رفتن mRNA می شود. کشف این رده از ژن ها یک لایه جدید از مکانیسم های تنظیم ژن را شناسایی کرده که نقش مهمی را در گسترش و فرآیندهای مختلف سلولی نظیر تمایز، رشد سلولی و مرگ سلولی دارد (2). انحراف از الگوی عادی بیان ممکن است در بیماری ها، مانند اختلالات نورولوژیکی (3) نقش داشته باشد.
Abstract
MicroRNAs (miRNAs) are a class of small noncoding RNAs that control gene expression by targeting mRNAs and triggering either translation repression or RNA degradation. Their aberrant expression may be involved in human diseases, including cancer. Indeed, miRNA aberrant expression has been previously found in human chronic lymphocytic leukemias, where miRNA signatures were associated with specific clinicobiological features. Here, we show that, compared with normal breast tissue, miRNAs are also aberrantly expressed in human breast cancer. The overall miRNA expression could clearly separate normal versus cancer tissues, with the most significantly deregulated miRNAs being mir-125b, mir-145, mir-21, and mir-155. Results were confirmed by microarray and Northern blot analyses. We could identify miRNAs whose expression was correlated with specific breast cancer biopathologic features, such as estrogen and progesterone receptor expression, tumor stage, vascular invasion, or proliferation index.
Introduction
MicroRNAs (miRNAs) represent a class of naturally occurring small noncoding RNA molecules, distinct from but related to small interfering RNAs. Mature miRNAs are 19- to 25-nucleotidelong molecules cleaved from 70- to 100-nucleotide hairpin premiRNA precursors (1). The precursor is cleaved by cytoplasmic RNase III Dicer into f22-nucleotide miRNA duplex: one strand (miRNA*) of the short-lived duplex is degraded, whereas the other strand serves as mature miRNA. In animals, single-stranded miRNA binds through partial sequence homology to the 3V untranslated region (3V UTR) of target mRNAs, and causes either block of translation or, less frequently, mRNA degradation. The discovery of this class of genes has identified a new layer of gene regulation mechanisms, which play an important role in development and in various cellular processes, such as differentiation, cell growth, and cell death (2). Deviations from normal pattern of expression may play a role in diseases, such as in neurologic disorders (3).
چکیده
مقدمه
مواد و روش ها
نمونه ها و لاین های سلولی سرطان پستان
تجزیه و تحلیل ایمنوهیستوشیمیایی نمونه های سرطان پستان
ریزآرایه MicroRNA
تجزیه و تحلیل آماری و بیوانفورماتیک داده های ریزآرایه
نورترن بلات
نتایج
یک امضای بیان microRNA بین بافت های طبیعی و سرطانی سینه تمایز ایجاد می کند
ویژگی های بیوپاتولوژیک و بیان microRNA
بحث
Abstract
Introduction
Materials and Methods
Results
Discussion