چکیده
مطالعه نظری منومرها و دیمرهای HXYH (X,Y=O, S, Se) با روشهای محاسباتی MP2 انجام میشوند. در منومرها ، ایزومریزاسیون (H2X=Y/HXYH) و سدهای انتقال چرخشی محاسبه میشوند. علاوه براین پتانسیل الکتروستاتیک مولکولی منومرها نیز بررسی میشوند. بدلیل ماهیت کایرال این ترکیبات ، دیمرهای هموکایرال و هتروکایرال شناسایی شده اند. تعداد مینیمم های یافت شده برای حلقه دیمری ، بین 13تا22 عدد میباشد.دانسیته الکترونی کمپلکسها با متدولوژی اتمها در مولکولها AIM، در تعداد زیادی از برهمکنشها مشخص شده است. روش DFT-SAPT برای آنالیز اجزای انرژی برهمکنش بکار میرود. با در نظر گرفتن برهمکنشهای کالکوژن-کالکوژن گرچه پاایدارترین مینیممها از بین پیوندهای هیدروژنی تشکیل میشوند (بویژه اگر گروههای OHای در مولکول وجود داشته باشد) اما همانطور که اندازه اتمهای درگیر در برهمکنش افزایش می یابد، برهمکنشهای کالکوژن-کالکوژن اهمیت بیشتری پیدا میکند.
1.مقدمه
از بین برهمکنشهای ضعیف، پیوند هیدروژنی (HB) بدون شک مهمترین این برهمکنشهاست. در سالهای اخیر تعدادی از گروههای جدیدی که میتوانند در برهمکنشهای ضعیف شرکت کنند مطالعه شده اند. در واقع سازمان IUPAC تعریف جدیدی از برهمکنشهای هیدروژنی با در نظر گرفتن اطلاعات جدید بدست آمده درمورد آنها، ارائه کرده است. در ادامه این روند، نوع جدیدی از برهمکنشها مثل پیوند هیدروژنی، پیوندهای هیدریدی ، یا برهمکنشهای کالکوژن-کالکوژن تعریف شده اند.
A theoretical study of the HXYH (X, Y ¼ O, S and Se) monomers and dimers has been carried out by means of MP2 computational methods. For the monomers, isomerization (H2X¼Y//HXYH) and rotational transition state barriers have been calculated. Additionally, the molecular electrostatic potential of the isolated monomers has also been analysed. Due to the chiral nature of these compounds, homo and heterochiral dimers have been explored. The number of minima found for the dimers range between 13 and 22. The electron density of the complexes has been characterized with the Atoms in Molecules (AIM) methodology finding a large variety of interactions. The DFT-SAPT method has been used to analyse the components of the interaction energies. Concerning chalcogen–chalcogen interactions, although the most stable minima are formed through hydrogen bonds (especially if OH groups are present in the molecules) as the size of the atoms involved in the interaction increase, the chalcogen–chalcogen contacts become more important.
1. Introduction
Among the weak interactions, hydrogen bond (HB) is without any doubt the most important one. In recent years, a variety of new groups that can be involved in this interaction have been described. In fact, IUPAC has issued a new definition of HB in order to cope with all the new information [1]. In parallel with these advances, new kind of interactions have been described such as halogen bonds [2], hydride bonds [3,4] or chalcogen–chalcogen interactions [5–14].
چکیده
1- مقدمه
2- جزئیات محاسبه
3- نتایج و بحث
3-1 منومرها
3-2 دیمرها
3-2-1 دیمر HSOH
3-2-2 دیمر HSSH
3-2-3 دیمر HSeOH
3-2-4 دیمر HSSeH
3-2-5 دیمر HSeSeH
3-3 بحث کلی
4- نتیجه گیری
1. Introduction
2. Computational details
3. Results and discussion
3.1. Monomers
3.2. Dimers
3.2.1. HSOH dimer
3.2.2. HSSH dimer
3.2.3. HSeOH dimer
3.2.4. HSeSH dimer
3.2.5. HSeSeH dimer
3.3. General discussion
4. Conclusions