ژن های کدکننده ی پروتئین کمتر از 1 درصد از کل ژنوم را تشکیل می دهند. با این حال، پیشرفت های صورت گرفته در توالی یابی RNA و آنالیز گسترده ی ژنوم نشان داده است که بیشترین بخش ژنوم قادر به رونویسی است. علاوه بر این، مطالعات اخیر نشان داده اند RNA های غیر کدکننده ی طویل (lncRNAs)، تنظیمکنندههای حیاتی بیان ژن و اپی ژنتیک در شرایط فیزیولوژیک و بیماری هستند. چندین lncRNAs از نظر عملکردی در بیماری های قلبی عروقی درگیر هستند و ممکن است اهداف درمانی بالقوه باشند. در اینجا، ما با تمرکز بر روی تکوین قلب، هایپرتروفی، نارسایی قلبی و آترواسکلروز، استراتژی های فعلی را برای کشف lncRNA های عملکردی و lncRNA هایی که اخیرا در حوزه ی قلب و عروق کشف شده اند؛ بررسی می کنیم. ما همچنین در مورد پتانسیل های درمانی RNA های سنتزی برای تنظیم این lncRNA ها و مسیرهای آینده در این زمینه ی تحقیقاتی بحث می کنیم.
پیشرفت های اخیر در روش های توالی یابی RNA همراه با فناوری بیوانفورماتیک امکان شناسایی تمام رونوشتهای RNA را فراهم کرده اند. کشف انواع مختلف RNA های غیر کد کننده ی پروتئین (ncRNAs) سطح دانش ما را در حوزه ی زیست شناسی مولکولی گسترش داده است. هزاران ncRNA را بر اساس طول آنها به دو دسته تقسیم کرده اند: ncRNA های کوچک با طول 200 نوکلئوتید و RNA های غیر کدکننده ی طویل (lncRNAs) با طول بیشتر از 200 نوکلئوتید. عملکرد میکرو RNA ها (miRNAs) که فراوان ترین کلاس ncRNA های کوچک هستند؛ به خوبی مستند شده است. با این حال، تایید فعالیت های بیولوژیک هر یک از lncRNA ها هنوز هم چالش برانگیز است که به دلیل حفاظت شدگی پایین آنها در میان مهره داران ، تنوع ساختارها و روش های متعدد فعالیت آنها است. بنابراین، هنوز هم تعداد زیادی از lncRNA ها وجود دارند که عملکرد آنها شناخته نشده است.
Protein-coding genes account for less than 2% of the whole genome. However, the advances in RNA sequencing and genome-wide analysis have demonstrated that most of the genome is capable of being transcribed. Moreover, recent studies have suggested that long non-coding RNAs (lncRNAs) are critical regulators of gene expression and epigenesis in both physiological and disease states. Several lncRNAs are functionally involved in cardiovascular diseases and may be potential therapeutic targets. Here, we review the current strategies for the discovery of functional lncRNAs and recently discovered lncRNAs in the cardiovascular field, focusing on cardiac development, hypertrophy, heart failure, and atherosclerosis. We also discuss the therapeutic potentials of synthetic RNAs to modulate these lncRNAs and future directions in this research field.
Recent developments in RNA-seq methods in conjunction with bioinformatics have enabled characterization of all RNA transcripts.1 The discovery of various types of non-protein-coding RNAs (ncRNAs) has expanded our knowledge of molecular biology. Thousands of ncRNAs have been classified into 2 groups depending on their length: small ncRNAs up to 200 nucleotides long, and long non-coding RNAs (lncRNAs) longer than 200 nucleotides. The functions of microRNAs (miRNAs), which are the most numerous class of small ncRNAs, are well documented.2–4 However, establishing the biological actions of each lncRNA is still challenging because of their low conservation among vertebrates, variety of structures, and multiple modalities of action. Therefore, there still remain a large number of lncRNAs with unknown functions.
استراتژی هایی برای شناسایی lncRNA های عملکردی
lncRNA های عملکردی در تکوین قلب
LncRNA های عملکردی در هایپرتروفی قلبی
lncRNA عملکردی در نارسایی قلبی
lncRNA های عملکردی در آترو اسکلروز
مسیرهای آینده ی در مطالعات پیرامون lncRNA ها
نتیجه گیری
منابع
Strategies for the Identification of Functional lncRNAs
Functional lncRNAs in Cardiac Development
Functional lncRNAs in Cardiac Hypertrophy
Functional lncRNAs in HF
Functional lncRNAs in Atherosclerosis
Future Directions of lncRNAs Studies
Conclusions