ترکیب کدون های آهسته انسانی
ترجمه نشده

ترکیب کدون های آهسته انسانی

عنوان فارسی مقاله: ترکیب کدون های آهسته انسانی و دی کدون های آهسته در SARS-CoV و ۲۰۱۹- nCoV کمتر از سایر کروناویروس ها است که نشان دهنده سرعت سنتز پروتئین سریعتر در SARS-CoV و ۲۰۱۹-nCoV است.
عنوان انگلیسی مقاله: Composition of human-specific slow codons and slow di-codons in SARS-CoV and 2019- nCoV are lower than other coronaviruses suggesting a faster protein synthesis rate of SARS-CoV and 2019-nCoV
مجله/کنفرانس: مجله میکروبیولوژی، ایمونولوژی و عفونت – Journal of Microbiology, Immunology and Infection
رشته های تحصیلی مرتبط: پزشکی
گرایش های تحصیلی مرتبط: ژنتیک پزشکی، ویروس شناسی پزشکی، بیماری های عفونی، پزشکی مولکولی
کلمات کلیدی فارسی: کروناویروس جدید ۲۰۱۹، کدون های آهسته خاص میزبان، ژن های tRNA میزبان
کلمات کلیدی انگلیسی: nCoV 2019، Host-specific slow codons، Host tRNA genes
نوع نگارش مقاله: مقاله پژوهشی (Research Article)
نمایه: Scopus – Master Journals List – JCR
شناسه دیجیتال (DOI): https://doi.org/10.1016/j.jmii.2020.03.002
دانشگاه: Department of Microbiology, Soochow University, Shih-Lin, Taipei 111, Taiwan
ناشر: الزویر - Elsevier
نوع ارائه مقاله: ژورنال
نوع مقاله: ISI
سال انتشار مقاله: 2020
ایمپکت فاکتور: 2.327 در سال 2019
شاخص H_index: 48 در سال 2020
شاخص SJR: 0.872 در سال 2019
شناسه ISSN: 1684-1182
شاخص Quartile (چارک): Q2 در سال 2019
فرمت مقاله انگلیسی: PDF
تعداد صفحات مقاله انگلیسی: 6
وضعیت ترجمه: ترجمه نشده است
قیمت مقاله انگلیسی: رایگان
آیا این مقاله بیس است: خیر
آیا این مقاله مدل مفهومی دارد: ندارد
آیا این مقاله پرسشنامه دارد: ندارد
آیا این مقاله متغیر دارد: ندارد
کد محصول: E14860
رفرنس: دارای رفرنس در داخل متن و انتهای مقاله
فهرست انگلیسی مطالب

Abstract


Introduction


Material and methods


Results


Discussion


References

نمونه متن انگلیسی مقاله

Abstract


Translation of a genetic codon without a cognate tRNA gene is affected by both the cognate tRNA availability and the interaction with non-cognate isoacceptor tRNAs. Moreover, two consecutive slow codons (slow di-codons) lead to a much slower translation rate. Calculating the composition of host specific slow codons and slow di-codons in the viral protein coding sequences can predict the order of viral protein synthesis rates between different virus strains. Comparison of human-specific slow codon and slow di-codon compositions in the genomes of 590 coronaviruses infect humans revealed that the protein synthetic rates of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) and severe acute respiratory syndrome-related coronavirus (SARS-CoV) may be much faster than other coronaviruses infect humans. Analysis of host-specific slow codon and di-codon compositions provides links between viral genomic sequences and capability of virus replication in host cells that may be useful for surveillance of the transmission potential of novel viruses.


Introduction


No organism has a full set of tRNA species for all 61 amino acid-encoded codons.1 Codons without cognate tRNA gene can be referred to as slow codons of the organism. These codons are organism specific codons because different organisms have different tRNA gene compositions. For example, 13 amino acid-encoding codons have no cognate tRNA genes in the human genome. Studies have revealed by ribosomal profiling experiments that translation of codons by rare tRNAs and non-cognate isoacceptor tRNAs (by wobble base pairing of codons and tRNAs) reduces translation efficiency2,3, . 4 Moreover, it has been reported that the efficiency of translating a particular codon is affected by the nature of the immediately adjacent codons.5,6 Two consecutive slow codons (slow di-codons) lead to a much slower translation rate. Conversely, coding sequences (CDSs) with low composition of slow codons and slow dicodons may possess fast translation rates. Translation of viral proteins is completely dependent on the translation machinery of host cells. Therefore, the proportions of host-specific slow codons and slow di-codons in the viral CDSs can be used to predict the order of viral protein synthesis rates between different viruses of different genera, serotypes, and strains.

  • اشتراک گذاری در

دیدگاه خود را بنویسید:

تاکنون دیدگاهی برای این نوشته ارسال نشده است

ترکیب کدون های آهسته انسانی
نوشته های مرتبط
مقالات جدید
پیوندها