دانلود مقاله رابطه خطر بستری شدن در بیمارستان با عفونت توسط واریانت امیکرون
چکیده
مقدمه
مطالب و روش ها
نتایج
بحث
به اشتراک گذاری داده ها
مطالب تکمیلی
منابع
Summary
Introduction
Methods
Results
Discussion
Data sharing
Declaration of interests
Supplementary Material
References
چکیده
پیش‌زمینه تخمین‌های شدت نوع امیکرون SARS-CoV-2 (B.1.1.529) برای ارزیابی تأثیر سلامت عمومی مرتبط با انتشار سریع جهانی آن بسیار مهم است. ما خطر بستری شدن مرتبط با SARS-CoV-2 را پس از عفونت با امیکرون در مقایسه با واریانت دلتا (B.1.617.2) در دانمارک، کشوری با پوشش واکسیناسیون mRNA بالا و ظرفیت گسترده آزمایش PCR رایگان و رایگان، تخمین زدیم.
روش‌ها در این مطالعه گروهی شهودی ما همه موارد تایید شده با RT-PCR عفونت SARS-CoV-2 در دانمارک را وارد کردیم، با نمونه‌هایی که بین 21 نوامبر (تاریخ اولین نمونه میکرون مثبت) و 19 دسامبر 2021 گرفته شد. افراد شناسایی شدند. در پایگاه داده ملی سیستم نظارت کووید-19، که شامل نتایج یک نوع RT-PCR خاص است که موارد امیکرون و داده‌های مربوط به بستری‌های مرتبط با SARS-CoV-2 (نتیجه اولیه مطالعه) را شناسایی می‌کند. ما نسبت خطر (RR) بستری شدن در بیمارستان پس از عفونت با امیکرون را در مقایسه با دلتا، به طور کلی و طبقه بندی شده بر اساس وضعیت واکسیناسیون، در یک مدل رگرسیون پواسون با SE های قوی، که پیشینی برای وضعیت عفونت مجدد، جنس، سن، منطقه، بیماری های همراه تنظیم شده است، محاسبه کردیم.
یافته‌ها بین 21 نوامبر و 19 دسامبر 2021، از میان 188980 فرد مبتلا به عفونت SARS-CoV-2، 38669 (20·5٪) واریانت امیکرون داشتند. بستری‌های مرتبط با SARS-CoV-2 و موارد امیکرون در طول دوره مطالعه افزایش یافت. به طور کلی، 124313 (65.8%) از 188980 نفر واکسینه شدند و واکسیناسیون با خطر کمتر بستری شدن در بیمارستان همراه بود (RR تعدیل شده 0.24، 95% فاصله اطمینان (CI 0.22-0.26) در مقایسه با موارد بدون دوز یا فقط یک دوز واکسن در مقایسه با عفونت دلتا، عفونت امیکرون با RR تعدیل شده بستری شدن در بیمارستان 0.64 همراه بود (95% فاصله اطمینان (CI): 0.56-0.75؛ 222 [0.6٪] از 38669 مورد امیکرون بستری در بیمارستان در مقابل 2213 [1·] 5٪] از 150311 مورد دلتا). برای مقایسه مشابه با وضعیت واکسیناسیون، RR بستری شدن در بیمارستان 0.57 (0.44-0.75) در بین موارد بدون یا تنها یک دوز واکسن، 0.71 (0.60-0.86) در بین آن‌ها بود. که دو دوز دریافت کردند، و 0.05 (0·32-0·76) در میان کسانی که سه دوز دریافت کردند.
تفسیر ما خطر بستری شدن در بیمارستان با عفونت امیکرون را در مقایسه با عفونت دلتا در بین افراد واکسینه نشده و واکسینه شده پیدا کردیم که نشان دهنده کاهش ذاتی شدت امیکرون است. نتایج ما می‌تواند مدل‌سازی اثر موج جهانی امیکرون و در نتیجه آمادگی سیستم بهداشت و دمان را راهنمایی کند.
توجه! این متن ترجمه ماشینی بوده و توسط مترجمین ای ترجمه، ترجمه نشده است.
Abstract
Background
Estimates of the severity of the SARS-CoV-2 omicron variant (B.1.1.529) are crucial to assess the public health impact associated with its rapid global dissemination. We estimated the risk of SARS-CoV-2-related hospitalisations after infection with omicron compared with the delta variant (B.1.617.2) in Denmark, a country with high mRNA vaccination coverage and extensive free-of-charge PCR testing capacity.
Methods
In this observational cohort study, we included all RT-PCR-confirmed cases of SARS-CoV-2 infection in Denmark, with samples taken between Nov 21 (date of first omicron-positive sample) and Dec 19, 2021. Individuals were identified in the national COVID-19 surveillance system database, which included results of a variant-specific RT-PCR that detected omicron cases, and data on SARS-CoV-2-related hospitalisations (primary outcome of the study). We calculated the risk ratio (RR) of hospitalisation after infection with omicron compared with delta, overall and stratified by vaccination status, in a Poisson regression model with robust SEs, adjusted a priori for reinfection status, sex, age, region, comorbidities, and time period.
Findings
Between Nov 21 and Dec 19, 2021, among the 188 980 individuals with SARS-CoV-2 infection, 38 669 (20·5%) had the omicron variant. SARS-CoV-2-related hospitalisations and omicron cases increased during the study period. Overall, 124 313 (65·8%) of 188 980 individuals were vaccinated, and vaccination was associated with a lower risk of hospitalisation (adjusted RR 0·24, 95% CI 0·22–0·26) compared with cases with no doses or only one dose of vaccine. Compared with delta infection, omicron infection was associated with an adjusted RR of hospitalisation of 0·64 (95% CI 0·56–0·75; 222 [0·6%] of 38 669 omicron cases admitted to hospital vs 2213 [1·5%] of 150 311 delta cases). For a similar comparison by vaccination status, the RR of hospitalisation was 0·57 (0·44–0·75) among cases with no or only one dose of vaccine, 0·71 (0·60–0·86) among those who received two doses, and 0·50 (0·32–0·76) among those who received three doses.
Interpretation
We found a significantly lower risk of hospitalisation with omicron infection compared with delta infection among both vaccinated and unvaccinated individuals, suggesting an inherent reduced severity of omicron. Our results could guide modelling of the effect of the ongoing global omicron wave and thus health-care system preparedness.
Funding
None.
Introduction
On Nov 26, 2021, the SARS-CoV-2 omicron variant (B.1.1.529) was designated a variant of concern (VOC) by WHO.1 2 days later, on Nov 28, 2021, the first two omicron cases were identified in Denmark in travellers returning from South Africa. Since this first detection, the omicron variant has spread rapidly in Denmark and comprised around 93% of the daily detected cases by Jan 3, 2022.2
The combination of mutations that define the omicron variant has been found to increase transmissibility compared with the delta variant (B.1.617.2) and is associated with marked immune escape, resulting in higher rates of reinfection and lower protection against infection by vaccination compared with delta.3, 4 With the rapid global spread of omicron, it is of critical public health importance to determine whether the omicron variant is associated with less severe disease than the delta variant. In South Africa, increased rates of hospitalisation were observed with rising case numbers at the epicentre of omicron infection, but the distribution of inpatients showed a skew towards younger populations, and these patients had shorter lengths of hospital stay and generally reduced oxygen requirements compared with hospitalised patients with COVID-19 in previous waves.5 However, this difference might be attributed to both a higher level of natural immunity in the population after extensive transmission of other variants in previous waves, as well as vaccine-induced immunity after the rollout of the vaccination programme. Conclusions on altered severity of omicron cannot be reached based on these findings alone. Therefore, observational studies at the individual level are needed to assess the severity of omicron relative to delta, taking previous infection and vaccination status into account. Furthermore, to detect severity the studies’ capacity to obtain variant information for all or representative severe or hospitalised cases, either by variant PCR or whole-genome sequencing, is crucial.
Results and analyses
Between Nov 21 and Dec 19, 2021, 2722 (1·4%) of 192 610 RT-PCR primary positive individuals in Denmark were excluded because of an inconclusive omicron vPCR test, and 908 (0·5%) were excluded because of missing name of which region the positive sample was from, leaving 188 980 (98·1%) eligible for inclusion in the study (appendix p 2). 38 669 (20·5%) of 188 980 were infected with omicron (as verified for 35 904 cases by TCDK vPCR and 2765 cases by CMD vPCR), and 2435 (1·3%) were hospitalised, of whom 222 (9·1%) were infected with omicron (table 1). The proportion of individuals with variants other than omicron and delta was extremely low during the study period, as described elsewhere.25